Учебная программа Духовного училища включает преподавание следующих предметов:
1 КУРС
| 1 | Библеистика |
| 2 | Вероучение Церкви |
| 3 | Основное богословие |
| 4 | Литургика |
| 5 | История Христианской Церкви |
| 6 | Отечественная история |
| 7 | Церковно-славянский язык |
| 8 | Церковное пение |
| 9 | Латинский язык |
| 10 | Английский язык |
| 11 | Русский язык и культура речи |
| 12 | Философия |
| 13 | Православие на Дальнем Востоке |
| 14 | Христианство и литература |
2 КУРС
| 1 | Священное Писание Ветхого Завета |
| 2 | Священное Писание Нового Завета |
| 3 | Догматическое богословие |
| 4 | Сравнительное богословие |
| 5 | Литургика |
| 6 | История Русской Церкви |
| 7 | История Поместных Православных Церквей |
| 8 | Патрология |
| 9 | Церковное пение |
| 10 | История религий |
| 11 | Древнегреческий язык |
3 КУРС
| 1 | Священное Писание Ветхого Завета |
| 2 | Священное Писание Нового Завета |
| 3 | Догматическое богословие |
| 4 | Сравнительное богословие |
| 5 | Нравственное богословие |
| 6 | Пастырское богословие |
| 7 | Литургика |
| 8 | Практическое руководство для пастырей |
| 9 | Гомилетика |
| 10 | Патрология |
| 11 | Каноническое право |
| 12 | Сектоведение |
| 13 | Латинский язык |
| 14 | История Русской Церкви |
| 15 | История и теория христианского искусства |
| 16 | Педагогика |
| 17 | Миссиология |
| 18 | Византология |
| 19 | Правовые основы деятельности прихода |
| 20 | Концепции современного естествознания |
| 21 | Логика и теория аргументации |
| 22 | Апологетика |